主要是4型变态反应引起，常见致敏物质有甲基丙烯酸甲酯、自凝丙烯酸酯、银汞合金、唇膏、泡泡糖等。在接触致敏物质半天甚至24小时以上，再接触过敏原即可发生反应，接触部位黏膜发红、水肿，在红斑上发生水疱、糜烂或溃疡，自觉灼痛。临床上用银汞合金做充填术后可见在接触的黏膜上出现类似扁平苔藓的病损，去除银汞充填物改用树脂充填，则病损可消退。
变态反应性口炎可根据用药名、发作史和临床表现来诊断。此外，尚可将可疑致敏物质固定于患者前臂屈侧皮肤上做斑贴试验，于48小时或72小时后观察反应有助于诊断。