在现实生产中，尤其是在集约化鸡场遇见的病例往往是由两种或两种以上的病原同时致病，如有两种病毒病或者两种细菌病同时发生，或者病毒病与细菌病、病毒病与寄生虫病、细菌病与寄生虫病同时发病。这种多病原的同时感染，给诊断和防治工作带来难度。
治疗病毒病和细菌病混合感染的疾病，要遵循以防制病毒病为主、治疗细菌病为辅的原则。即鸡群疫病发生时，一般情况下应紧急接种疫苗。因为鸡群发病时，不可能所有的鸡只都发病；尽管紧急接种疫苗可能会加速一些危重病鸡的死亡，但能及时挽救大多数未感染得病的鸡只，是非常值得的。